Система генетичного аналізу PyroMark Q24 з приладдям, QIAGEN GmbH, Німеччина

Система генетического анализа PyroMark Q24 с принадлежностями, QIAGEN GmbH, Германия

Система PyroMark Q24 основана на технологии пиросеквенирования – «секвенирование путем синтеза». Уникальность системы PyroMark заключается в возможности сочетать надежные количественные результаты с секвенированием в течение нескольких минут в режиме реального времени.

В состав системы генетического анализа входит прибор пиросеквенатор PyroMarkТМ Q24 и интуитивно понятное программное обеспечение PyroMarkТМ Q24 Analysis Software. Система PyroMark Q24 снабжается станцией для вакуумной пробоподготовки, реагентами и контролями.

Преимущества:

●Высокоточные результаты в эпигенетических и онкологических исследованиях.

●Возможность обнаружения единичных однонуклеотидных замен, вставок и делеций.

●Надежный количественный анализ частот аллельной встречаемости и статуса метилирования.

●Исследование и анализ редких мутаций и сайтов метилирования. Анализ метилирования может быть совмещен с SNP типированием.

●Компактные размеры, простота в обращении и сервисном обслуживании прибора.

●Одновременное проведение генетического анализа 24 образцов меньше, чем за 15 минут.

Области применения:

Система генетического анализа PyroMarkТМ Q24 широко используется для клинических и научных исследований, в том числе для детекции генетических полиморфизмов, а также для мониторинга и выявления новых соматических мутаций при развитии онкологических заболеваний.

Устройство:

Прибор пиросеквенатор PyroMarkТМ Q24 состоит из: нагревательного блока (рис. 1), распределительного блока с разъемом для картриджа с реагентами, необходимыми для проведения реакции (рис. 2) и детектирующего блока, который представляет собой 24 CCD камеры, расположенные прямо под нагревательным блоком.

Рис 1. Нагревательный блок	Рис 2. Распределительный блок с картриджем для реагентов

Принцип работы:

●Микропланшет PyroMark с подготовленными образцами помещается в нагревательный блок. Картридж для реагентов PyroMark Q24 заправляется необходимыми реагентами и вставляется в распределительный блок.

●USB - накопитель с программным обеспечением вставляется в USB порт, который находится на передней панели прибора. Далее прибор запускается.

●В распределительном блоке происходит смешивание и подача реагентов в лунки микропланшета.

●При встраивании нуклеотида в растущую цепь ДНК происходит выделение пирофосфата, который запускает каскад ферментативных реакций, последняя из которых представляет собой реакцию окисления люцеферина до оксилюцеферина. При этом происходит выделение света в видимом диапазоне. Лунки планшета для секвенирования имеет оптически прозрачное дно. CCD камеры детектируют свет, исходящий из лунок с положительными реакциями (при встраивании нуклеотидов в последовательность). Результаты отображаются на пирограмме в виде пиков.

●Сбор данных осуществляется с помощью 24-х ССD камер, которые располагаются под каждой лункой. Благодаря этим камерам происходит регистрация сигнала и программное обеспечение интерпретирует силу данного сигнала в виде пирограммы, где высота пика соответствует интенсивности сигнала.

●После каждого пробега данные автоматически сохраняются.

Пиросеквенирование: сочетание секвенирования и количественного анализа